根据《国家重要热带作物工程技术研究中心管理体系建设指导性意见》的通知（热科院成果〔2020〕179号），决定调整国家重要热带作物工程技术研究中心内设机构，具体如下:
  一、中心办公室
  工程中心的日常管理部门，负责工程中心日常工作的管理、协调、落实、服务工作。
  办公室主任：专职副主任（兼）
  副 主 任：香饮所、橡胶所、加工所、热作高科公司分管负责人
  成 员：香饮所（专职）、橡胶所（专责）、加工所（专责）、热作高科公司（专责）各一人
  二、中心实体
  工程中心的市场运营实体，在授权范围内开展市场化运营和中试转化。
  1.海南热作高科技研究院股份公司：运作海口和儋州科技成果转移转化基地。
  2.海南兴科热带作物工程技术有限公司：运作兴隆热带香辛饮料成果转化基地。
  3.海南热农橡胶科技服务中心有限公司：运作天然橡胶大科学工程。
  4.湛江市凯翔科技有限公司：运作热带农产品加工与装备基地。
  三、中心分支机构
  工程中心的研发及辐射基地，在授权范围内开展技术研发、技术集成、中试转化等工作。包括各分中心、研发中心、研究院（三亚研究院、广州研究院、云南研究院、广西研究院、攀枝花研究院）、世界热区联合研发中心等。